Статья раскрывает роль конкурентоспособности регионов и их конкурентных преимуществ в обеспечении экономической безопасности, рассмотрены факторы, обусловливающие оценку уровня региональной конкурентоспособности, определены причины, препятствующие ее росту. Экономическая безопасность региона должна обеспечивать интеграцию региональной экономической системы в национальную экономику, но в то же время региональные экономические системы должны находиться в состоянии конкуренции за человеческие, финансовые, инвестиционные и другие ресурсы. Конкурентная борьба регионов обусловлена наличием у них определенных конкурентных преимуществ. Оценка конкурентоспособности региона и уровня его экономической безопасности производится на основе идентичных показателей, при этом оба эти концепта являются взаимосвязанными и взаимозависимыми характеристиками региональных экономических систем. Формирование новых подходов в федеральной территориальной экономике должно быть основана на развитии сложившихся и выявлении новых конкурентных преимуществ регионов с целью повышения уровня региональной и национальной экономической безопасности.